Emerald Shore kører på en progressionsbaseret match-3-motor, hvor spillere avancerer gennem 200+ håndlavede kystniveauer. Hvert niveau præsenterer et unikt gitterlayout fyldt med tropiske ædelstene, muslingeskaller og havskatte, der skal matches i grupper på tre eller flere for at klare mål og optjene point.
Spillet implementerer et kombomultiplikator-system, der belønner på hinanden følgende matches inden for et enkelt træk. Når spillere laver matches på fire eller flere genstande, låser de op for specialiserede havtema-boostere, herunder Tidevandsbølgen (horisontal rydder), Hvirvelvinden (radial eksplosion) og Skattekisten (farveombe). Disse power-ups kan kombineres for ødelæggende kædereaktioner, der rydder hele sektioner af brættet.
Daglige strandudfordringer opdateres hver 24. time og tilbyder tidsbegrænsede mål, der belønner bonus-søstjernevaluta. Denne valuta låser permanente opgraderinger op i Kystsamlings-systemet, hvor spillere genopbygger og tilpasser deres eget strandparadis. Det stjernebaserede progressionssystem kræver, at man optjener en til tre stjerner per niveau for at låse nye kystzoner op, hver med unikke mekanikker som tidevandstimere, sandslots-forhindringer og perlesamlingsmål.